220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5109 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  97.95 
 
 		 341 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  99.71 
 
 		 341 aa  675    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  92.08 
 
 		 341 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  82.27 
 
 		 344 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  80.81 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  83.87 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  77.98 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  68.4 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  68.4 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48080  Cell division protein FtsX  69.72 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0869301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  40.84 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  43.6 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  41.89 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  41.75 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  41.75 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  41.22 
 
 		 321 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  41.55 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  42.96 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  41.22 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  41.22 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  42.33 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  42.33 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  42.41 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  41.22 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  42.23 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  42.76 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  38.93 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  40.74 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  41.22 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  39.39 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  38.74 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2990  protein of unknown function DUF214  45.34 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  37.37 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  36.39 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  45.42 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  37.25 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  37.5 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  36.79 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  36.7 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  36.45 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  35.05 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  32.63 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  34.34 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  34.34 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  34.34 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  34.34 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  34.14 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  42.21 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  34.09 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  34.09 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  34.09 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  35.1 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  43.09 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  33.23 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  35.81 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  41.12 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  38.91 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  40.13 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  37.84 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  34.44 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  30.91 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  34.47 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  33.89 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  37.79 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  31.8 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  32.57 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3716  cell division protein FtsX  35.12 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.339466  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  34.35 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  37.82 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  37.45 
 
 		 312 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  42.67 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  28.48 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  30.36 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  27.13 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  25.6 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  28.62 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  28.67 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  34.04 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0168  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  32.76 
 
 		 295 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  21.65 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  26.5 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>