60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1153 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  87.07 
 
 
316 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  72.79 
 
 
322 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  77.15 
 
 
323 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  75.42 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  75.42 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  59.11 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  51.01 
 
 
343 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  47.1 
 
 
314 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  47.44 
 
 
333 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  47.44 
 
 
333 aa  259  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  46.76 
 
 
347 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  47.42 
 
 
323 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  48.06 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  47.96 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  46.62 
 
 
329 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  42.71 
 
 
337 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  42.02 
 
 
337 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  48.41 
 
 
327 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  44.37 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  48.06 
 
 
326 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  41.89 
 
 
316 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  43.93 
 
 
339 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  48.85 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  33.56 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  41.3 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.57 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  36.51 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.99 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  32.85 
 
 
300 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  37.38 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  36.92 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  36.92 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  32.34 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  38.55 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.02 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  39.08 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  32.51 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.91 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  28.5 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  28 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  26.02 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  25.44 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  20.69 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  24.22 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  26.32 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  24.15 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  24.15 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  24.15 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  29.72 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  26.34 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  26.26 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  23.46 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  27.19 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  22.77 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>