83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3071 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 345 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  43.2 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  34.13 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  32.14 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  29.37 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  32.61 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  34.76 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  34.76 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  29.76 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  34.09 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  29.49 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  27.78 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  27.24 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  31.28 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  31.05 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  30.31 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  29.39 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  27.2 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  33.49 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  31.98 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  32.08 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  28.34 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  28.21 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  24.45 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  29.36 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  29.36 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  28.44 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  24.12 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  26.15 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  23.53 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  25.1 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  24.91 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  34.21 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  40.86 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  29.78 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  25.11 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  30.1 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  25.31 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  25.31 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  34.82 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  27.12 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  26.14 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.24 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0567  hypothetical protein  26.95 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  28.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  28.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  28.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  28.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  28.65 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.21 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  23.72 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.21 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.21 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  32.26 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  22.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  28.12 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  32.82 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  32.82 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.38 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  27.63 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  32.63 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  23.48 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  29.61 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  23.11 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  24.76 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  27.81 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  25.69 
 
 		 1090 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  23.88 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  26.42 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>