45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1594 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  36.57 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  38.62 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  41.52 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  40.53 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  33.56 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  42.18 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  33.22 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  37.04 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  36.36 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  33.22 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  39.04 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  40.76 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  39.82 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  37.72 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  36.12 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  37.93 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  36.01 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  39.91 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  40.6 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  36.79 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  28.04 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  35.85 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  37.68 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  39.44 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  37.56 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  35.69 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  37.56 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.77 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  32.51 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  37.07 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  38.14 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  38.14 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  39.45 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  29.69 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  34.56 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  31.34 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  28.16 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  33.87 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>