49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0700 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  45.15 
 
 
303 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  41.1 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  37.37 
 
 
298 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  35.83 
 
 
327 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  34.82 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  30.03 
 
 
323 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  34.34 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  29.81 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  34.36 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  36.99 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  33.21 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  29.72 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  28.14 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  31.7 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  36.09 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  32.34 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  25.71 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  28.08 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.51 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  30.37 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  26.6 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  32.42 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  32.14 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  26.14 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  26.14 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  24.35 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  25.08 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  32.42 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  32.42 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  28.9 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  35.59 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  35.12 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  23.47 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.33 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.33 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.33 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  29.96 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  24.92 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  26.87 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  25.45 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  33.75 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  25.09 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>