46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3866 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  100 
 
 
337 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  97.03 
 
 
337 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  78.91 
 
 
316 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  75.68 
 
 
339 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  58.31 
 
 
347 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  57 
 
 
333 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  57 
 
 
333 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  54.55 
 
 
329 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  43.73 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  41.56 
 
 
323 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  41.16 
 
 
322 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  40.51 
 
 
314 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  42.71 
 
 
317 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  43.54 
 
 
323 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  43.2 
 
 
326 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  43.2 
 
 
326 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  40.58 
 
 
323 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.2 
 
 
333 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  41.29 
 
 
343 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  41.59 
 
 
319 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  40.95 
 
 
316 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 
328 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  41.22 
 
 
349 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  37.99 
 
 
326 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  39.35 
 
 
327 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.04 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.96 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  32.2 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  31.62 
 
 
297 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.62 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  34.27 
 
 
309 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.67 
 
 
300 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  29.72 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  29.72 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  26.35 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  31.58 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  25.56 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  25.52 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  26.29 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  23.81 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  23.81 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  24.76 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  24.87 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  26.57 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>