92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0668 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  92.36 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  84.52 
 
 		 323 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  78.3 
 
 		 319 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  76.42 
 
 		 328 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  79.25 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  79.25 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  46.82 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  46.82 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  45.54 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  47.84 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  47.56 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  47.42 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  48.29 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  41.56 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  41.69 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  46.96 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  46.96 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  48.38 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  45.95 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  43.93 
 
 		 339 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  46.97 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  39.33 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  34.92 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  38.62 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  36.41 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  34.01 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  32.84 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  34.48 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  31.7 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  31.86 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  36.82 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  33.16 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  33.16 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.89 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.64 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.64 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.64 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  26.2 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  23.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  23.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  26.83 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  23.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  23.02 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  23.02 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  28.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  29.31 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  24.26 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  25.16 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  23.4 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  23.4 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 290 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  27.49 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  24.58 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  22.22 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  26.29 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  23.57 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  26.82 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  26.39 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  20.72 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  23.48 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  23.77 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  25.14 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  23.77 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  21.54 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  18.7 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  23.28 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.82 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  21.43 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.82 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  21.71 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  21.32 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  23.87 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  24.5 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  21.19 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>