202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2372 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  100 
 
 
330 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  65.85 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  66.46 
 
 
322 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  55.87 
 
 
317 aa  348  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  36.82 
 
 
324 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  35.33 
 
 
326 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  34.7 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  34.7 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  34.7 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  33.74 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  36.4 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 
321 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  34.56 
 
 
321 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  34.56 
 
 
321 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  37.16 
 
 
328 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  34.25 
 
 
321 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  35.33 
 
 
321 aa  192  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  34.87 
 
 
321 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  35.82 
 
 
351 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  35.82 
 
 
351 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  35.82 
 
 
351 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  35.82 
 
 
351 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  35.33 
 
 
321 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  33.44 
 
 
321 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  35.2 
 
 
321 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  35.2 
 
 
321 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  34.89 
 
 
352 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  35.46 
 
 
351 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  35 
 
 
321 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  34.54 
 
 
321 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  34.67 
 
 
321 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  35.34 
 
 
321 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  35.33 
 
 
321 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  35.99 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  33.78 
 
 
300 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  32.52 
 
 
330 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  33.64 
 
 
321 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  34.53 
 
 
335 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  37.06 
 
 
315 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  33.88 
 
 
309 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  36.4 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  33.55 
 
 
309 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  31.61 
 
 
341 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  31.61 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  32.57 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  31.61 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  34.16 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  30.31 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
301 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  33.44 
 
 
326 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  33.11 
 
 
301 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  33.23 
 
 
335 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  32.52 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  37.42 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  34.39 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  29.22 
 
 
313 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  32.66 
 
 
302 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2990  protein of unknown function DUF214  35.19 
 
 
326 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  32.32 
 
 
338 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  31.71 
 
 
344 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  32.78 
 
 
344 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48080  Cell division protein FtsX  31.82 
 
 
335 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0869301  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  29.37 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
275 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  32.06 
 
 
341 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  32.38 
 
 
299 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  32.38 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  32.85 
 
 
312 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  36.48 
 
 
348 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  32.38 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 
315 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 
298 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3716  cell division protein FtsX  30.27 
 
 
299 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.339466  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  30.11 
 
 
308 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 
327 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  26.56 
 
 
333 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  26.09 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  25.81 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  26.15 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  26.81 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  28.64 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
314 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  22.03 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  22.3 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  22.58 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  25.76 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5480  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142715  normal  0.559065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>