208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1769 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  71.67 
 
 
293 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2283  protein of unknown function DUF214  70.99 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  57.99 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  65.07 
 
 
295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  57.29 
 
 
290 aa  349  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  61.56 
 
 
295 aa  349  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  38.83 
 
 
293 aa  175  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  28.67 
 
 
294 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  28.14 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1243  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
292 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.046416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1255  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  27.97 
 
 
302 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  30.94 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
301 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
296 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  27.44 
 
 
304 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  29.26 
 
 
298 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
304 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2182  cell division protein FtsX  30.77 
 
 
292 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  28.14 
 
 
295 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
296 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0390  hypothetical protein  26.48 
 
 
297 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  26.96 
 
 
321 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
296 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  28.44 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0786  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.663734  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0951  cell division protein FtsX  26.09 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  27.42 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  24.32 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  26.29 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  27.74 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  28.27 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  24.69 
 
 
303 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.66 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  24.66 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  24.66 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  24.66 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  24.66 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.66 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.66 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.5 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  24.83 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  25.36 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0983  hypothetical protein  23.84 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0567  hypothetical protein  28.02 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  28.46 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.89 
 
 
275 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  23.79 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04535  putative cell division protein  27.81 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1536  cell division protein FtsX, putative  26.43 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  30.12 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  27.89 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  29.67 
 
 
312 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  25.47 
 
 
305 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  29.72 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  29.72 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  24.59 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  27.71 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  23.65 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1759  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.899046  normal  0.32093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  26.67 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.92 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  27.8 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  29.32 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  26.17 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  24.57 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  25.2 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3544  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  28.92 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  28.92 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  27.45 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  26.61 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.64 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3021  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  27.34 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  26.27 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  28.85 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  28.72 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  26.77 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  25.4 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  25.88 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1867  hypothetical protein  27.56 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581756  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  27.06 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>