86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0835 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  92.05 
 
 		 326 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  84.45 
 
 		 328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  79.25 
 
 		 323 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  78.03 
 
 		 314 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  77.06 
 
 		 323 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  76.73 
 
 		 319 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  45.62 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  45.62 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  45.86 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  45.64 
 
 		 322 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  42.99 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  47.7 
 
 		 329 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  49.12 
 
 		 349 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  46.36 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  39.35 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  46.38 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  50.83 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  38.71 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  44.26 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  44.26 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  43.77 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  40.06 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  38.33 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  36.49 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.07 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  36.04 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  33.78 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  32.3 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  28.11 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  33.93 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  33.03 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.91 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  31.28 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  31.72 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  31.28 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  32.55 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  34.09 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  30.49 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  28.76 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  28.76 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  28.76 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  28.11 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  28.57 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  28.57 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  28.57 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  28.57 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  28.57 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.7 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  31.13 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  28.7 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  29.36 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.12 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  29.3 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  24.19 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  26.6 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  25.19 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  23.67 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  24.72 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  25.28 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  26.02 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  27.22 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  23.68 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  23.11 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  24.19 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  24.81 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  27.84 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  27.67 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  25.51 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  22.36 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  27.09 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  22.99 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  24.05 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>