207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2901 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  100 
 
 
317 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  54.92 
 
 
322 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  55.95 
 
 
330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  54.6 
 
 
322 aa  351  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  41.67 
 
 
326 aa  248  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03535  cell division protein  42 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0178612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  39.8 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  39.18 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  39.79 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  39.18 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  39.79 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  39.79 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  39.79 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  39.18 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  39.79 
 
 
351 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  37.7 
 
 
317 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  41.89 
 
 
328 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  39.33 
 
 
321 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  37.96 
 
 
321 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  38.8 
 
 
352 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  39.33 
 
 
321 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  39.33 
 
 
321 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  39 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 
321 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  38.33 
 
 
321 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  38.33 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  38 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  37.67 
 
 
321 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  37.67 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  37.33 
 
 
321 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  37.72 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  37.84 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  37.33 
 
 
321 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  37.67 
 
 
321 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  37.3 
 
 
323 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  38 
 
 
321 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  38.41 
 
 
322 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  36.67 
 
 
321 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  37 
 
 
321 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  34.34 
 
 
300 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  36.65 
 
 
312 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  37.38 
 
 
335 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  35.91 
 
 
341 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  34.47 
 
 
341 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  34.47 
 
 
341 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  34.16 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  33.11 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  32.99 
 
 
301 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 
301 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  34.07 
 
 
330 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  34.56 
 
 
309 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  37.67 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  34.23 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2990  protein of unknown function DUF214  38.87 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  34.49 
 
 
291 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  35.33 
 
 
302 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
275 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  33.77 
 
 
335 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  33.77 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  36.31 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  35.02 
 
 
338 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  34.34 
 
 
344 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  34.01 
 
 
344 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  34.23 
 
 
341 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48080  Cell division protein FtsX  34.34 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0869301  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  33.11 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 
298 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  34.77 
 
 
348 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  31.23 
 
 
316 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  31.94 
 
 
312 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  29.29 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  31.79 
 
 
312 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  30.1 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3716  cell division protein FtsX  31.79 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.339466  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  30.99 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  28 
 
 
333 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
327 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  27.71 
 
 
314 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  31.02 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  26.62 
 
 
293 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  26.1 
 
 
316 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04535  putative cell division protein  27.03 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5480  protein of unknown function DUF214  27.63 
 
 
304 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142715  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  27.9 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  27.9 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  27.9 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  27.9 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>