54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3090 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  61.33 
 
 
347 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  62.21 
 
 
333 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  62.21 
 
 
333 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  55.48 
 
 
337 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  54.55 
 
 
337 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  58 
 
 
339 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  56.67 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  46.67 
 
 
324 aa  293  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  46.71 
 
 
314 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  47.17 
 
 
323 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  46.62 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  45.72 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  43.73 
 
 
322 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  47.3 
 
 
327 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  45.61 
 
 
323 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  47.46 
 
 
349 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  45.61 
 
 
326 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  45.61 
 
 
326 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  44.34 
 
 
323 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  46.67 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  43.75 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  45.76 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  43.37 
 
 
343 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  42.86 
 
 
333 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  33.67 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  36.65 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.64 
 
 
297 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  36.89 
 
 
297 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.47 
 
 
300 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  32.3 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.66 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  32.14 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  30.91 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  30.91 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  30.22 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  27.45 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  24.29 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  26.19 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  24.81 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  24.81 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  24.81 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.23 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  26.47 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  27.69 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  26.24 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  24.49 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  24.49 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  24.49 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  26.05 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  25.74 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>