76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0363 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  59.8 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  48.91 
 
 
322 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  47.84 
 
 
323 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  48.98 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  51.01 
 
 
317 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  52.84 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  52.84 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  51.84 
 
 
323 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  47.81 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  49.67 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  45.13 
 
 
319 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  47 
 
 
328 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  45.3 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  45.89 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  41.08 
 
 
333 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  41.08 
 
 
333 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  40.76 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  40.62 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  40.33 
 
 
347 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  51.11 
 
 
333 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  43.55 
 
 
316 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  42.95 
 
 
329 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  36.82 
 
 
324 aa  216  4e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  41.76 
 
 
339 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  34.02 
 
 
327 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.83 
 
 
298 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.99 
 
 
300 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  35.86 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  33.49 
 
 
297 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  34.76 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  36.49 
 
 
297 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  35.19 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  35.19 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  34.27 
 
 
309 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.12 
 
 
303 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  31.7 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  31.42 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  35.14 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  25.37 
 
 
333 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  29.3 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  25.61 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  28.37 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  28.37 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  28.37 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 
345 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.61 
 
 
312 aa  53.1  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  25.17 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  28.19 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  30.41 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  25 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  25.17 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  24.17 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  27.69 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  30.32 
 
 
341 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  25.22 
 
 
351 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  30.41 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.86 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  25.41 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  23.89 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  24.79 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  23.33 
 
 
322 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>