56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3083 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  44.62 
 
 
345 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  32.41 
 
 
298 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  33.19 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  34.06 
 
 
323 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  31.88 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  30.8 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  32.86 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  35.03 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  32.09 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  33.48 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  30 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  34.25 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  31.6 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  31.4 
 
 
343 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  32.44 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  36.44 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  30.8 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  31.65 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  31.65 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  32.06 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  29.67 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  29.67 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  32.38 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  26.76 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  28.63 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  26.64 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  30.45 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  28.77 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  28.05 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  28.05 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  29.68 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  27.62 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  27.35 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  30.27 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  24.42 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.76 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  26.33 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  25 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.92 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.92 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.92 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  27.9 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  25.38 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  25.94 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  27.24 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  25.94 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  25.94 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  25.94 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  25.94 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  25.52 
 
 
351 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  20.76 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>