255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3608 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  31.21 
 
 
294 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  31.74 
 
 
295 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  32.67 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  31.54 
 
 
295 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  31.1 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  31.43 
 
 
297 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  31.11 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
294 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  29.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  29.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  29.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  29.68 
 
 
297 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  30.79 
 
 
297 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  30.79 
 
 
297 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  30.16 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
296 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  33 
 
 
302 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  29.24 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  26.56 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  28.88 
 
 
295 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  31.06 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  26.54 
 
 
304 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  28.53 
 
 
309 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 
296 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  28.96 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  25.62 
 
 
311 aa  99  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  25.08 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  27.42 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  24.17 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  25 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  26.4 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  27.78 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  27.24 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0520  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.35 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  26 
 
 
301 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0390  hypothetical protein  28.93 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0731  cell division protein FtsX  30.27 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  27.72 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  25.17 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2914  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.56 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.56 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.56 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  25.97 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  25.41 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  26.69 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0279  cell division protein FtsX  26.34 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25180  cell division protein FtsX  27.04 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293384  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0023  hypothetical protein  21.69 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.51 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1612  cell division protein FtsX  24.78 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1637  cell division protein FtsX  24.78 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1583  cell division protein FtsX  24.78 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1243  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.046416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2723  hypothetical protein  28.33 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  28.97 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1915  hypothetical protein  23.76 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1036  cell division protein FtsX  32.7 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  26.67 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  26.72 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  24.66 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5480  protein of unknown function DUF214  20.73 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142715  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13118  cell division protein ftsX  26.19 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  26.69 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  25.91 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  26.72 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  26.72 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0799  cell division protein FtsX  28.63 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0488  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  26.72 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  26.72 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  27.46 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  26.37 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.46 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  23.24 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1245  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.82 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  25.26 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4447  hypothetical protein  26.43 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>