216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1288 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
314 aa  623  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  97.45 
 
 
314 aa  583  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  60.7 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  66.88 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  63.49 
 
 
321 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  59.16 
 
 
316 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  60.66 
 
 
316 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  36.73 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  27.63 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  29.22 
 
 
302 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  30.38 
 
 
294 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  28.76 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  29.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  29.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  29.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  29.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.43 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  31.6 
 
 
295 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.43 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  29.43 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  30.45 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  30.33 
 
 
297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  27.41 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  26.82 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  24.25 
 
 
295 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  29 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  28.35 
 
 
351 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.42 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.42 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.42 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
296 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  31.45 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  27.3 
 
 
295 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  26.78 
 
 
294 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  27.92 
 
 
302 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
297 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5480  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
304 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142715  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  26.92 
 
 
305 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
351 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
294 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
351 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
351 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
351 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  28.87 
 
 
351 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  29.06 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  23.47 
 
 
301 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  25.6 
 
 
317 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 
304 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07710  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
299 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  30.71 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  27.27 
 
 
322 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  25.08 
 
 
302 aa  99.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0702  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0095  cell division protein FtsX  27.23 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  26.38 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  27.39 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0701  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3021  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  22.18 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  24.38 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
290 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  27.84 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
301 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0567  hypothetical protein  23.55 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0946  cell division protein FtsX  25.61 
 
 
300 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  23.34 
 
 
321 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3875  cell division protein FtsX  24.66 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.939193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  23.4 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0115  cell division protein FtsX  27.05 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  20.9 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  31.12 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002140  cell division protein FtsX  26.86 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000746474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  27.46 
 
 
330 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0983  hypothetical protein  26.42 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  25.95 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  24.06 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  22.08 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  27.3 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  27.98 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>