187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0799 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0799  cell division protein FtsX  100 
 
 
290 aa  567  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5791  hypothetical protein  76.21 
 
 
290 aa  342  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 
301 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  38.1 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0983  hypothetical protein  36.77 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  35.62 
 
 
301 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0919  hypothetical protein  35.74 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1867  hypothetical protein  33.89 
 
 
296 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581756  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  32.8 
 
 
302 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1408  cell division protein FtsX  34.52 
 
 
310 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00140955  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3780  protein of unknown function DUF214  36.99 
 
 
301 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  33.12 
 
 
304 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07710  cell division protein FtsX  34.56 
 
 
299 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  33.55 
 
 
303 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25180  cell division protein FtsX  35.16 
 
 
304 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293384  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1245  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 
304 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0865  cell division protein FtsX  38.22 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0946  cell division protein FtsX  33.67 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1612  cell division protein FtsX  33.22 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1637  cell division protein FtsX  33.22 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1583  cell division protein FtsX  33.22 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799502  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0940  cell division protein  32.03 
 
 
307 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.677903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3021  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2768  protein of unknown function DUF214  33.77 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13118  cell division protein ftsX  30.77 
 
 
297 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1678  protein of unknown function DUF214  37.05 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00327805  normal  0.350066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3452  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1071  efflux ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1036  cell division protein FtsX  33.99 
 
 
304 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  29.32 
 
 
305 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1915  hypothetical protein  30.67 
 
 
298 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  34.91 
 
 
295 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4447  hypothetical protein  30.82 
 
 
298 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  29.67 
 
 
302 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1730  cell division protein FtsX  30.13 
 
 
306 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1269  cell division protein FtsX  31.77 
 
 
303 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  27.89 
 
 
311 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
296 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  27.3 
 
 
295 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
304 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  29 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  27.14 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  28.98 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  26.32 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  30.55 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  24.24 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  22.66 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
301 aa  85.9  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  30.43 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  26.78 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2914  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  31.74 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  28.63 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  26.09 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  25.7 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  25.7 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  25.7 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  25.7 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.7 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.7 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.7 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.7 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  25.7 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  26.64 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  25.27 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  30.08 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  23.04 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  29.78 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  28.95 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0279  cell division protein FtsX  27.54 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  24.44 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  27.16 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2723  hypothetical protein  26.47 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1481  hypothetical protein  31.18 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  24.23 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2182  cell division protein FtsX  23.63 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1255  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  26.7 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  31.75 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  29.15 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  28.45 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  28.38 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  25.61 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0448  cell division protein FtsX  25.12 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.610578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>