179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0023 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0023  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  567  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2033  protein of unknown function DUF214  60.33 
 
 
300 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0115  cell division protein FtsX  48.08 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3113  protein of unknown function DUF214  35.52 
 
 
290 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0008  protein of unknown function DUF214  37.68 
 
 
291 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  24.03 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  21.71 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  22.14 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  21.69 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  22.59 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  24.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  24.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  24.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  24.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.08 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.08 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.08 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2661  cell division protein FtsX  29.68 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  23.75 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  20.13 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  23.41 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  26.67 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0214  cell division protein  23.53 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0407775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  31.02 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  30.53 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  23.96 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  29.09 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.28 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  23.08 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  31.19 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  23.57 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2372  cell division protein FtsX  26.13 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000210413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  27.92 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2914  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  29.09 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3744  hypothetical protein  30.9 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2303  hypothetical protein  31.67 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  29.09 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  29.38 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  29.27 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1100  cell division ABC transporter, permease  25.69 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  26.16 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  24.07 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  25.51 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  32.16 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  34.94 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  31.45 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  29.94 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  29.94 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  32.91 
 
 
344 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  32.48 
 
 
341 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  26.8 
 
 
326 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  29.82 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  29.82 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  29.82 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  23.23 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0279  cell division protein FtsX  27.89 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3595  cell division protein FtsX  31.71 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00012744  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  28.31 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  25.21 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  25.21 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  27.12 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4173  cell division protein FtsX  31.76 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4326  hypothetical protein  22.3 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  25.52 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  25.68 
 
 
314 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1612  cell division protein FtsX  26.45 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1637  cell division protein FtsX  26.45 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736883  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1583  cell division protein FtsX  26.45 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799502  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1769  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00766371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  30.56 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1408  cell division protein FtsX  32.86 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00140955  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  24.4 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0488  protein of unknown function DUF214  29 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4447  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  26.55 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20320  cell division protein  27.61 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1071  efflux ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  34.4 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2723  hypothetical protein  27.76 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1915  hypothetical protein  27.2 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  25.09 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>