273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2460 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  73.44 
 
 		 64 aa  95.9  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  63.49 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  65.08 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 403 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  56.6 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  46.3 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>