More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2486 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
150 aa  311  2e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58 
 
 
149 aa  180  5e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  59.46 
 
 
149 aa  177  3e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  59.46 
 
 
149 aa  177  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.14 
 
 
154 aa  174  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  56 
 
 
149 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  59.86 
 
 
158 aa  167  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  59.03 
 
 
148 aa  167  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  52.67 
 
 
149 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  50 
 
 
153 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52 
 
 
149 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52 
 
 
149 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  51.33 
 
 
149 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  51.68 
 
 
151 aa  150  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0988  NifU family protein  55.81 
 
 
126 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  50.34 
 
 
160 aa  137  4e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  46.71 
 
 
171 aa  137  5e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.06 
 
 
159 aa  136  8e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  47.06 
 
 
159 aa  136  8e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  45.77 
 
 
162 aa  134  3e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.14 
 
 
137 aa  127  7e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  45.99 
 
 
151 aa  127  7e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  45.26 
 
 
140 aa  125  1e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  46.43 
 
 
137 aa  125  2e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  44.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  44.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  44.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  44.78 
 
 
163 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.78 
 
 
163 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  46.76 
 
 
147 aa  123  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.05 
 
 
154 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.05 
 
 
154 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  44.78 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  44.03 
 
 
163 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  45.32 
 
 
160 aa  119  1e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.84 
 
 
165 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.15 
 
 
153 aa  119  2e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  44.29 
 
 
141 aa  116  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  42.14 
 
 
152 aa  113  7e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  39.31 
 
 
147 aa  112  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.17 
 
 
145 aa  112  2e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.07 
 
 
149 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.72 
 
 
145 aa  110  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.3 
 
 
153 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.04 
 
 
139 aa  107  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4802  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 
143 aa  106  8e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0118  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  41.61 
 
 
143 aa  107  8e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4689  NifU family protein  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5120  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4848  NifU domain-containing protein  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  39.29 
 
 
144 aa  106  9e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4704  NifU family protein  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5117  NifU domain-containing protein  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5122  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0356779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5085  iron-sulfur cluster assembly scaffold SufA  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  41.61 
 
 
143 aa  106  9e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  43.38 
 
 
154 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.55 
 
 
142 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.69 
 
 
131 aa  104  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.77 
 
 
135 aa  103  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3576  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.88 
 
 
143 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  41.61 
 
 
172 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.11 
 
 
155 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.3 
 
 
128 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.14 
 
 
151 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.48 
 
 
132 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2035  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  35.25 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0269  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.5 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  40 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2053  NifU domain-containing protein  36.3 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.415003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.23 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.58 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  43.41 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.43 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21900  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38 
 
 
178 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.43 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2555  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.93 
 
 
150 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.69 
 
 
150 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2268  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.41 
 
 
151 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  37.5 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.20118e-08  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2274  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.33 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0398  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.14 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.16 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.53 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.78 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.71916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  42.22 
 
 
140 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13390  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00685407  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.03 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12880  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.09 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.46 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  35.97 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.22 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.93 
 
 
140 aa  90.5  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.24 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  38.28 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.59 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>