266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0235 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 165 aa  345  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  57.14 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  55.7 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  52.17 
 
 		 162 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  44.91 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 171 aa  163  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  46.25 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.65 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  43.21 
 
 		 175 aa  154  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.28 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.1 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  44.65 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  46.54 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  52.11 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  45.91 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  39.41 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>