29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1398 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 697 aa  1436    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.21 
 
 		 672 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  24.45 
 
 		 676 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  23.72 
 
 		 654 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  24.85 
 
 		 708 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  24.48 
 
 		 591 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  31.42 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  23.98 
 
 		 654 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.65 
 
 		 614 aa  94.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  26.6 
 
 		 670 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.83 
 
 		 681 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  30 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  25.3 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.6 
 
 		 642 aa  52  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  25.86 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.27 
 
 		 582 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.33 
 
 		 652 aa  48.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  35.29 
 
 		 369 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.91 
 
 		 608 aa  47.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  43.18 
 
 		 496 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  22.31 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  27.08 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  37.7 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  32.14 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  28.1 
 
 		 368 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.63 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.09 
 
 		 616 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  38.3 
 
 		 666 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25 
 
 		 641 aa  43.9  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>