More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3727 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  51 
 
 
757 aa  671  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
758 aa  671  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  51.82 
 
 
734 aa  675  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  51.25 
 
 
756 aa  673  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  84.95 
 
 
712 aa  1187  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  58.49 
 
 
731 aa  712  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  54.65 
 
 
712 aa  682  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  52.26 
 
 
758 aa  675  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  52.44 
 
 
732 aa  658  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  52.85 
 
 
955 aa  673  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  57.75 
 
 
722 aa  719  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  55.71 
 
 
904 aa  741  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  55.05 
 
 
716 aa  678  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  54.17 
 
 
726 aa  719  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  52.75 
 
 
734 aa  689  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
711 aa  1398  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  54.41 
 
 
738 aa  746  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  59.19 
 
 
731 aa  734  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  57.99 
 
 
793 aa  762  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  70.69 
 
 
713 aa  979  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  51.65 
 
 
740 aa  662  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  51.92 
 
 
740 aa  669  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  52.79 
 
 
814 aa  686  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  50.07 
 
 
764 aa  654  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  52.31 
 
 
704 aa  674  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  69.93 
 
 
634 aa  802  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  52.7 
 
 
744 aa  659  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  57.33 
 
 
718 aa  733  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  53.67 
 
 
844 aa  692  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  70.54 
 
 
720 aa  968  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  55.27 
 
 
678 aa  652  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  64.15 
 
 
709 aa  853  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  54.43 
 
 
803 aa  678  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.51 
 
 
773 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  52.25 
 
 
759 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  47.86 
 
 
768 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  52.47 
 
 
759 aa  621  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.14 
 
 
689 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.67 
 
 
803 aa  595  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.57 
 
 
771 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.73 
 
 
728 aa  592  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.22 
 
 
768 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  49 
 
 
777 aa  576  1e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  48.72 
 
 
732 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.72 
 
 
732 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  49.01 
 
 
732 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  48.72 
 
 
732 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.56 
 
 
784 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.86 
 
 
732 aa  563  1e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  564  1e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  563  1e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 
732 aa  565  1e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.44 
 
 
732 aa  562  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.21 
 
 
787 aa  558  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.16 
 
 
732 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.3 
 
 
732 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.29 
 
 
732 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
707 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.37 
 
 
782 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.37 
 
 
782 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.76 
 
 
788 aa  540  1e-152  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
712 aa  540  1e-152  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
712 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
712 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3233  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  73.6 
 
 
381 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.73 
 
 
709 aa  498  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
783 aa  494  1e-138  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
984 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
984 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
767 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.26 
 
 
738 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
734 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  48.17 
 
 
673 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
713 aa  479  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
748 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
939 aa  475  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.47 
 
 
751 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.17 
 
 
750 aa  470  1e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
712 aa  471  1e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
726 aa  472  1e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 
734 aa  471  1e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
799 aa  466  1e-130  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
800 aa  466  1e-130  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
800 aa  466  1e-130  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
800 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.73 
 
 
742 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  40.73 
 
 
801 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
972 aa  462  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.45 
 
 
735 aa  461  1e-128  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  40.99 
 
 
812 aa  459  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
800 aa  462  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
800 aa  462  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
791 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
833 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.21 
 
 
769 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
750 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
800 aa  447  1e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  65.5 
 
 
344 aa  446  1e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>