49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3656 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  42.55 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  36.45 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  25.64 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  26.21 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  28.18 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  28.18 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  28.38 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  28.93 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  34.07 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1358  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0849787  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  25.96 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  27.73 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  26.61 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8090  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.958297  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  26.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  24 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.18 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  26.89 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 123 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 345 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>