More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0118 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  56.36 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.64 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  54.64 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  56.7 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  55.67 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  55.67 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  55.67 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  51.96 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  54.17 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  49.02 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  45.54 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  48.98 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  45.79 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  47.27 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  48.54 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  48.08 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  48.08 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.45 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  48.15 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  46.88 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  46.15 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.49 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  44.23 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  46.73 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  51.04 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  48.96 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  44.04 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  44.76 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  44.23 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  42.06 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  48.51 
 
 		 111 aa  106  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  49.48 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  49 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  46.88 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  45.28 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  45.79 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  44.34 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  42.06 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  45.71 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  53.68 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  49.48 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  42.99 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  43.4 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  45.79 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>