183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4390 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.67 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.08 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65.57 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.35 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  66.1 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.7 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.16 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  65.45 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  51.95 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  78.26 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.54 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  70.37 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  70.37 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.07 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.68 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  55.71 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.14 
 
 
72 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  55.71 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.28 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.81 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.81 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.81 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  68.63 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  62.5 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.29 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.43 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.1 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.33 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  62.96 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.49 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.78 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.89 
 
 
78 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.9 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.12 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.12 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.12 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
75 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  54.72 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.33 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.67 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.16 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  45.1 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
85 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.33 
 
 
82 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.16 
 
 
80 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.94 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
94 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.54 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.71 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>