More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2577 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.35 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
277 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  39.45 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.21 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.19 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
389 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  34.29 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  34.04 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  34.55 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.7 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.04 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.67 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  44.87 
 
 
711 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.93 
 
 
189 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.46 
 
 
566 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.46 
 
 
566 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 
278 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.64 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  40.51 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  36.96 
 
 
547 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  36 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  32.95 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  34.57 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  38.27 
 
 
353 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.78 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  38.46 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  35.79 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  35.79 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  35.79 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.69 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  43.59 
 
 
711 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.65 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.98 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 
480 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
284 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40 
 
 
478 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
484 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 
478 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 
478 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
484 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 
282 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.07 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  30 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>