More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0031 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
399 aa  805    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  62.53 
 
 
461 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  61.6 
 
 
400 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  59.43 
 
 
407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.02 
 
 
393 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.61 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  57.36 
 
 
404 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.81 
 
 
409 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.09 
 
 
398 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.17 
 
 
402 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  50.55 
 
 
395 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
395 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.79 
 
 
385 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.51 
 
 
394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.93 
 
 
404 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  43 
 
 
453 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  43.59 
 
 
454 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  43.47 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.2 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.43 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.85 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.99 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.09 
 
 
392 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.47 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.04 
 
 
386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.81 
 
 
384 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.15 
 
 
387 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.5 
 
 
385 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.9 
 
 
393 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.31 
 
 
402 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.15 
 
 
387 aa  296  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.38 
 
 
397 aa  295  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.04 
 
 
401 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.48 
 
 
408 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.4 
 
 
386 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  42.04 
 
 
382 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.65 
 
 
385 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.75 
 
 
396 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.03 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.6 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  41.98 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.51 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.74 
 
 
392 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.21 
 
 
399 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.82 
 
 
415 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  43.47 
 
 
396 aa  279  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.69 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.36 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.31 
 
 
397 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.66 
 
 
402 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.94 
 
 
386 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.36 
 
 
396 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.56 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.37 
 
 
394 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.68 
 
 
386 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  43.38 
 
 
402 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.55 
 
 
391 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  38.85 
 
 
391 aa  259  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.39 
 
 
410 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.26 
 
 
389 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.47 
 
 
392 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.89 
 
 
387 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.99 
 
 
396 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.69 
 
 
396 aa  256  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
376 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.95 
 
 
376 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  39.21 
 
 
408 aa  255  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25572  predicted protein  41.52 
 
 
470 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  36.39 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.81 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.25 
 
 
404 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.45 
 
 
396 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.76 
 
 
389 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.73 
 
 
401 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.18 
 
 
402 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.18 
 
 
393 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.21 
 
 
396 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.18 
 
 
392 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.05 
 
 
389 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
387 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.7 
 
 
409 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.74 
 
 
408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0539  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  38.04 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  38.2 
 
 
395 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03020  Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  38.15 
 
 
426 aa  242  7.999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.388117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.14 
 
 
397 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.53 
 
 
395 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  38.36 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  38.36 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.3 
 
 
404 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2728  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.5 
 
 
403 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.335629  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1295  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.98 
 
 
403 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5829  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.34 
 
 
395 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.628432  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2955  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.98 
 
 
403 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0522083  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.5 
 
 
394 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.82 
 
 
395 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  36.93 
 
 
394 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.96 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.89 
 
 
404 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>