32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2370 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
397 aa  791    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  70.24 
 
 
380 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  63.54 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  56.75 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  54.17 
 
 
368 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  42.47 
 
 
395 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  43.18 
 
 
419 aa  256  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  44.8 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  44.8 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  42.9 
 
 
390 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  40.46 
 
 
398 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  39.73 
 
 
397 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  40.68 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  41.78 
 
 
388 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  38.9 
 
 
397 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  38.63 
 
 
397 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  35.47 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.35 
 
 
652 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  30.41 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  30.41 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.72 
 
 
711 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  25.29 
 
 
470 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.73 
 
 
522 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
732 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  32.68 
 
 
1750 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.64 
 
 
1079 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  24.46 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.91 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  22.97 
 
 
504 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 
1163 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  20.98 
 
 
903 aa  43.1  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0812  hypothetical protein  28.42 
 
 
495 aa  42.7  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>