More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2899 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  65.53 
 
 
259 aa  266  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  54.74 
 
 
226 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  55.17 
 
 
226 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  52.59 
 
 
226 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  47.81 
 
 
231 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  51.28 
 
 
227 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  48.03 
 
 
232 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  53.91 
 
 
232 aa  184  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  51.71 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  47.88 
 
 
232 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  46.58 
 
 
231 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  47.01 
 
 
230 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  46.49 
 
 
233 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  49.78 
 
 
224 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  45.3 
 
 
231 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  37.07 
 
 
220 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  36.68 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  36.68 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  36.68 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  38.05 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  35.06 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  38.16 
 
 
218 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  39.58 
 
 
229 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  39.46 
 
 
213 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  34.98 
 
 
228 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  40.28 
 
 
213 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  33.75 
 
 
235 aa  99  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  39.1 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  39.39 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  34.18 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  33.75 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  30.54 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  41.63 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  32.59 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  35.09 
 
 
229 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  33.91 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  33.91 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  35.56 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.12 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  35.56 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  43.85 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.56 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  35.56 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  33.91 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  33.91 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  40.8 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  33.91 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  35.56 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.56 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.56 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  35.56 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  29.57 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  34.25 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.81 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  36.57 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.28 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  39.53 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  34.1 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  34 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  39.47 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  38.35 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  34.42 
 
 
233 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  33.5 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  39.23 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  35.61 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  36.73 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  34.72 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  35.94 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  31.61 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.92 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  37.33 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  34.02 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  29.82 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  34.29 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  38.19 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  37.84 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1251  peptidase M22 glycoprotease  30.41 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0110331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  36 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  34.09 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.35 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  34.09 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  34.09 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  30.94 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  37.23 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1401  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  32.17 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  34.59 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  33.13 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  35.07 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  36.25 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  35.25 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  31.34 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  31.67 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  35.11 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>