More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1328 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1000    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.2 
 
 
497 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.39 
 
 
495 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.53 
 
 
485 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.2 
 
 
497 aa  699    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.39 
 
 
500 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.72 
 
 
496 aa  733    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.19 
 
 
499 aa  686    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.54 
 
 
498 aa  741    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.75 
 
 
484 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.52 
 
 
496 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.28 
 
 
494 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.08 
 
 
487 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.07 
 
 
494 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.54 
 
 
498 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 
500 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.24 
 
 
498 aa  742    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.77 
 
 
497 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.74 
 
 
487 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.11 
 
 
497 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.54 
 
 
498 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.72 
 
 
498 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.11 
 
 
497 aa  722    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 
485 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.62 
 
 
500 aa  708    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  72.11 
 
 
532 aa  686    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.75 
 
 
497 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.79 
 
 
497 aa  700    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.72 
 
 
496 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.52 
 
 
489 aa  688    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.43 
 
 
496 aa  857    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.13 
 
 
486 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.12 
 
 
510 aa  720    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.3 
 
 
500 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
499 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.52 
 
 
482 aa  621  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.91 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.5 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 
486 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.5 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.68 
 
 
482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.7 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  594  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.99 
 
 
487 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 
487 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
487 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  59.92 
 
 
486 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.19 
 
 
487 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
487 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.67 
 
 
486 aa  585  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
488 aa  586  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.67 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
491 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.84 
 
 
556 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.78 
 
 
487 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.18 
 
 
491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 
489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.38 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.9 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.38 
 
 
483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.49 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.96 
 
 
489 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  57.32 
 
 
484 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  57.58 
 
 
490 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  57.58 
 
 
490 aa  569  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.3 
 
 
488 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
489 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.38 
 
 
490 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.87 
 
 
494 aa  565  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
485 aa  565  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
487 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.14 
 
 
492 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.83 
 
 
508 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.03 
 
 
497 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.44 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.44 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.96 
 
 
489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.44 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.02 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.56 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>