233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0672 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  52.1 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  34.55 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  32.87 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  31.19 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  31.03 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  31.72 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  30.99 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  30.67 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  33.77 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  30.99 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  30.22 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  31.01 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  30.39 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  29.19 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  31.54 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  32.89 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  32.36 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  30.82 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  33.46 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  32.23 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  29.73 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  33.71 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  29.74 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  29.74 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  29.75 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  33.57 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  27.95 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  28.96 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  28.28 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  29.06 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  32.1 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  34.34 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  28.37 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  31.76 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  32.96 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  32.58 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  28.21 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.38 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  28.46 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  28.98 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  32.37 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  26.46 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  29.39 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  25.72 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  28.28 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  26.51 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  31.56 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  26.81 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  25.9 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0972  homoserine kinase  31.76 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.779201  normal  0.0398229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  25.72 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  27.27 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  29.41 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  25.36 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  28.21 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.04 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  26.52 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.04 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  27.04 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.17 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  27.21 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  34.02 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  25.63 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  25.63 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  25.63 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  28.36 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  25.98 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  26.83 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  30.07 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  26.2 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1119  homoserine kinase  28.16 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  27.27 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  28.68 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  28.21 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  31.56 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  27.72 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  25 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  25 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  24.73 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  27.86 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  29.41 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  26.45 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  24.56 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  28.98 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  27.68 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  26.41 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  27.51 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>