39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0070 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  67.13 
 
 		 216 aa  305  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  53.63 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  51.91 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  60.27 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  50.57 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  52.38 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  53.18 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  50.8 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  51.72 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  51.74 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  51.15 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  50.58 
 
 		 194 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  51.16 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  45.99 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  49.43 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  52.03 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  52.05 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  51.19 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  52.69 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  48.84 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  50.92 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  52.35 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  51.01 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  47.73 
 
 		 154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  41.08 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.95 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  41.95 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  42.5 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.162573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  41.36 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1980  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.280522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0588  50S ribosomal protein L13E  63.27 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1663  ribosomal protein L13  59.18 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.129766  hitchhiker  0.00645105 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0690  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0678  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0734  ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0451901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>