More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1823 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  59.04 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  59.76 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0267  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.600979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09361  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00615512  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  57.32 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  55.95 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  54.76 
 
 		 88 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>