More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0141 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  87.27 
 
 
112 aa  203  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  79.05 
 
 
118 aa  177  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  55.79 
 
 
99 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  47.71 
 
 
107 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  48.54 
 
 
117 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  44.35 
 
 
115 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  42.45 
 
 
134 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  47.46 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  46.08 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  41.51 
 
 
154 aa  96.7  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  45.79 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  48.45 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  51 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  47.06 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  45.1 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.33 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  47.42 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  45.54 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  43.3 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  44.44 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  47 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  44.86 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  45.95 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  43.75 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  43.88 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  49 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  41.75 
 
 
129 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  48.35 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  45.26 
 
 
122 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  42.39 
 
 
212 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  46.23 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  39.02 
 
 
123 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  41.44 
 
 
112 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  41.44 
 
 
112 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  44.23 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  44.04 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  41.44 
 
 
112 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  40.34 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  46.46 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  40.82 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  41.59 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  45.19 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.73 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  43.75 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  46.74 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  44.44 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  44.21 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  40.59 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  42.72 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.18 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.14 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  45.63 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  46.53 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  43.56 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  45.54 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.71 
 
 
160 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  37.27 
 
 
144 aa  87  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 
238 aa  86.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  40.2 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  42.72 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  48.45 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2866  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  45 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  44.66 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  41.51 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.9 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  47.73 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  47.73 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  45.98 
 
 
105 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
164 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  46.08 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  38.68 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  39.05 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  42.42 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  39.58 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  42.86 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  40.82 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.9 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  39.6 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  40.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  38.54 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  41.41 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  43.69 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  38.54 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  41.94 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  38.54 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40 
 
 
197 aa  80.5  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>