159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3721 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  275  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  74.32 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  69.34 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  68.92 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  71.01 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  56.12 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  52.74 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  52.82 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  51.7 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  52.05 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  49.18 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  45.32 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  51.33 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  41.89 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  45.65 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  45.65 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  40.58 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  38.57 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  42.11 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  43.57 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  44.2 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  39.29 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  39.46 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  43.26 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  39.86 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  38.57 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  39.46 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  47.25 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.57 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  45.32 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  42.59 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  41.73 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.06 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  39.29 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  41.55 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  33.81 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  38.13 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.07 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  33.58 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  36.72 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  36.72 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  33.09 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  45.45 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  38.24 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  36.3 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  40.88 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  36.03 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  38.41 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  33.58 
 
 		 297 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  34.03 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  43.75 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  32.81 
 
 		 317 aa  64.7  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  35.97 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  33.86 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.16 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  35.56 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  35.25 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  30.66 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  34.81 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  34.81 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  32.61 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  35.9 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  28.32 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  38.82 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  34.58 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.19 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  33.79 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  37.84 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  26.43 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  34.53 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  26.43 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  29.37 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  29.37 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  31.16 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  34.57 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  35.9 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  32.28 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  27.81 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  35.53 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  34.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>