138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0444 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 82 aa  166  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  67.07 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  66.25 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  63.41 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  53.66 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  51.25 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  46.25 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  46.25 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  47.5 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  40.24 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  46.05 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  40.26 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  36.59 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.8 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  37.33 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  34.15 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  37.33 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  38.67 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.71 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.67 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.67 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.67 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  38.75 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  32.5 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  41.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  42.59 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  42.59 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  36.59 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  37.14 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  35.9 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  42.59 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  35.37 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  40.54 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  47.17 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  45.28 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  41.67 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  35.87 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  42.31 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  34.62 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  34.07 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  44.64 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000771327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  45.28 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  36.92 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3441  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.0000520161  normal  0.334367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  49.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  37.68 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  38.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  37.8 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  43.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  34.12 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 97 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 94 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 98 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 97 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  43.4 
 
 		 102 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  36.54 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>