27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7743 on replicon NC_011888
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  46.71 
 
 
175 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1588  hypothetical protein  48.91 
 
 
96 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  26.42 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  28.19 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  27.35 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  28.18 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  25.21 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  27.43 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  37 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  28.96 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  24.89 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  27.62 
 
 
225 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  28.64 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  22.13 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  24.43 
 
 
342 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  27.37 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  24.71 
 
 
308 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  29.27 
 
 
146 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  23.64 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  22.43 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  25.16 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  34.88 
 
 
186 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  29.55 
 
 
210 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  25.74 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  23.32 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  32.35 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>