24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5911 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  70.26 
 
 		 279 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  55.56 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  54.79 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  54.44 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  53.69 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  36.4 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  37.76 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  34.84 
 
 		 259 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  38.55 
 
 		 264 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  32.02 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  34.26 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  38.6 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  35.42 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  29.73 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  37.68 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  35.07 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  35.03 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  31.6 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  25.11 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  21.88 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  25.73 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>