More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2651 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  100 
 
 
475 aa  962    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  62.31 
 
 
480 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  53.05 
 
 
483 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  55.08 
 
 
480 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  52.63 
 
 
483 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  55.51 
 
 
480 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  55.3 
 
 
480 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  55.72 
 
 
481 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  54.87 
 
 
480 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35460  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  55.72 
 
 
481 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.0108121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2989  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  55.51 
 
 
481 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2699  amino acid carrier protein  48.93 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  47.71 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  46.68 
 
 
477 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  48.12 
 
 
477 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3608  amino acid carrier protein  51.07 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221851  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  47.81 
 
 
476 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  46.6 
 
 
458 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  44.75 
 
 
470 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  45.32 
 
 
498 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  44.7 
 
 
493 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.4 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  46.68 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  44.4 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  43.93 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  44.4 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  44.51 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  44.4 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  47.49 
 
 
502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  44.68 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  47.11 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  43.72 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
480 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 
479 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  44.28 
 
 
481 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 
479 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  44.65 
 
 
502 aa  405  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  45.61 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  43.48 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.8 
 
 
478 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  44.73 
 
 
466 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  44.52 
 
 
466 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  46.72 
 
 
483 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  43.04 
 
 
476 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  45.15 
 
 
470 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 
476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  42.35 
 
 
477 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  42.83 
 
 
476 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  42.35 
 
 
477 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  42.83 
 
 
476 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  43.74 
 
 
476 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  42.83 
 
 
476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.04 
 
 
476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  46.84 
 
 
472 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  46.84 
 
 
472 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  42.47 
 
 
489 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  42.98 
 
 
489 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  44.96 
 
 
485 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  45.02 
 
 
477 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.07 
 
 
476 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  42.95 
 
 
496 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  43.57 
 
 
493 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  42.71 
 
 
504 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  42.86 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  42.86 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  42.86 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  42.86 
 
 
503 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  45.09 
 
 
486 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  42.43 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  42.86 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  45.09 
 
 
486 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  44.25 
 
 
484 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  42.86 
 
 
503 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  42.92 
 
 
480 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  42.49 
 
 
504 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 
486 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 
486 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 
486 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  42.28 
 
 
497 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  42.49 
 
 
486 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.56 
 
 
477 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  42.07 
 
 
495 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  42.44 
 
 
488 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  42.64 
 
 
503 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.35 
 
 
477 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  44.4 
 
 
477 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 
487 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  42.28 
 
 
487 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 
486 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  42.35 
 
 
477 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.14 
 
 
477 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 
486 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  40.5 
 
 
493 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  42.28 
 
 
497 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.35 
 
 
477 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  43.6 
 
 
479 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  42.01 
 
 
504 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  44.54 
 
 
492 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  42.28 
 
 
497 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  42.77 
 
 
477 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>