56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3728 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  31.22 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  27.37 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  30.85 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  28.36 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  30.73 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  34.84 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  28.57 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  29.61 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  29.41 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  32.26 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  26.63 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  33.33 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  26.84 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  32.26 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  31.85 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  28.8 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  29.61 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  28.81 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  30.51 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  25.13 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  25.28 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  25.28 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  29.94 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  34.33 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  23.38 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  32.37 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  28.89 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  27.82 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  27.07 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  27.07 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  29.05 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  29.93 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  28.36 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  31.08 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  29.27 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  29.58 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  26.73 
 
 		 244 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  27.61 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.68 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  35.19 
 
 		 93 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  27.06 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  48.28 
 
 		 110 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  48.28 
 
 		 110 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  26.15 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  25.41 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>