51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0551 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  100 
 
 		 688 aa  1444    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  42.79 
 
 		 662 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  43.78 
 
 		 655 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  38.25 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  37.54 
 
 		 618 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  37.99 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  36.08 
 
 		 615 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  35.93 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  35.77 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  37.62 
 
 		 670 aa  364  3e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  33.48 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  35.57 
 
 		 689 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  36.4 
 
 		 688 aa  320  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  24.7 
 
 		 658 aa  207  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  27.19 
 
 		 571 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  27.04 
 
 		 566 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  26.97 
 
 		 566 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.92 
 
 		 757 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  26.8 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.03 
 
 		 241 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  31.03 
 
 		 241 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.03 
 
 		 241 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.3 
 
 		 247 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 346 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 346 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  28.66 
 
 		 346 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  28.3 
 
 		 346 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  34.15 
 
 		 471 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  28.88 
 
 		 211 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.71 
 
 		 883 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.87 
 
 		 307 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.18 
 
 		 227 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  23.86 
 
 		 487 aa  51.2  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.48 
 
 		 211 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  26.37 
 
 		 350 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.52 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.45 
 
 		 204 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.2 
 
 		 211 aa  45.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>