More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1247 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
346 aa  692    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.07 
 
 
357 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.24 
 
 
356 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
359 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.5 
 
 
359 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.36 
 
 
388 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.77 
 
 
357 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.65 
 
 
363 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.65 
 
 
357 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.95 
 
 
355 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.1 
 
 
348 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.5 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.78 
 
 
349 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.53 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.94 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.8 
 
 
348 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.72 
 
 
357 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.72 
 
 
357 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.9 
 
 
357 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  58.53 
 
 
802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.31 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.75 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.34 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
348 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.47 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.79 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.99 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.31 
 
 
341 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.98 
 
 
356 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.08 
 
 
355 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60 
 
 
355 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.08 
 
 
359 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.36 
 
 
348 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.08 
 
 
355 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.78 
 
 
355 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.14 
 
 
363 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  58.1 
 
 
1237 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.89 
 
 
352 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.93 
 
 
368 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.62 
 
 
369 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.7 
 
 
366 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.57 
 
 
348 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.87 
 
 
348 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.87 
 
 
347 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.29 
 
 
363 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.33 
 
 
368 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.98 
 
 
351 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  52.98 
 
 
795 aa  364  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
345 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
350 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.59 
 
 
346 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.49 
 
 
346 aa  360  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.4 
 
 
351 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.41 
 
 
345 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.71 
 
 
348 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.36 
 
 
356 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.09 
 
 
354 aa  358  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.18 
 
 
346 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.39 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.29 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.19 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.65 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.55 
 
 
345 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.76 
 
 
345 aa  355  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.99 
 
 
352 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.99 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.27 
 
 
346 aa  355  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.3 
 
 
363 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.39 
 
 
349 aa  353  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.69 
 
 
345 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
351 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.69 
 
 
345 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2623  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.98 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  0.159504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.94 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.79 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.1 
 
 
349 aa  351  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.52 
 
 
350 aa  351  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.79 
 
 
345 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  54.47 
 
 
809 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.29 
 
 
348 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.69 
 
 
359 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.17 
 
 
356 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.49 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.61 
 
 
345 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.79 
 
 
345 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>