218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09730 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  94.59 
 
 
73 bp  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  94.44 
 
 
76 bp  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  92.75 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  92.75 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  93.44 
 
 
74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  93.44 
 
 
74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0091  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000502507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  93.44 
 
 
74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000040989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  91.04 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  93.22 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.86 
 
 
80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000168657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  91.3 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0109  tRNA-Arg  88.41 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  89.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  87.69 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  89.23 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0003  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0031  tRNA-Arg  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86.89 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86.89 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  88.52 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86.89 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  90.38 
 
 
76 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0730  tRNA-Thr  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  84.29 
 
 
77 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  87.04 
 
 
77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4566  tRNA-Arg  84.06 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  84.06 
 
 
80 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0120  tRNA-Arg  84.06 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  84.06 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000137515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  86.15 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  88.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0638  tRNA-Arg  84.06 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375137  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5793  tRNA-Arg  84.06 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0292581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>