More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1355 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
425 aa  864    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.05 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.17 
 
 
448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.04 
 
 
430 aa  317  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 
442 aa  292  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
461 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  29.01 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4827  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.33 
 
 
539 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.38 
 
 
470 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  27.01 
 
 
466 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.48 
 
 
484 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  27.13 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.7 
 
 
484 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 
450 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.42 
 
 
463 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  27.42 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  27.48 
 
 
451 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  28.28 
 
 
452 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  27.63 
 
 
451 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.91 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 
563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 
562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  28.21 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  28.97 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.35 
 
 
459 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.62 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  27.56 
 
 
451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3174  NADPH-glutathione reductase  27.8 
 
 
484 aa  116  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.36 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.26 
 
 
767 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  27.33 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.17 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  27.25 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  27.73 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  25.06 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.3 
 
 
481 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0151  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.26 
 
 
467 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  24.53 
 
 
451 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  27.13 
 
 
452 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 
465 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.11 
 
 
470 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  28.24 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  28.94 
 
 
745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  27.46 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  25.65 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.32 
 
 
562 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  29.45 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  27.59 
 
 
452 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.08 
 
 
448 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  27.63 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  31.1 
 
 
448 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  31.13 
 
 
470 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  29.75 
 
 
562 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  28.57 
 
 
461 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  31.11 
 
 
449 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  26.48 
 
 
452 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  27.91 
 
 
475 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  25 
 
 
452 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  28.57 
 
 
460 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.02 
 
 
455 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  27.8 
 
 
461 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  30.51 
 
 
713 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.77 
 
 
458 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.03 
 
 
465 aa  106  7e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2747  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.02 
 
 
469 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  27.67 
 
 
478 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  29.43 
 
 
550 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.03 
 
 
465 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.94 
 
 
458 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  26.26 
 
 
459 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  27.44 
 
 
448 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.16 
 
 
546 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.38 
 
 
712 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2737  glutathione reductase  28.23 
 
 
483 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.482914  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.07 
 
 
585 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  30.5 
 
 
457 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  28.07 
 
 
473 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.16 
 
 
551 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  27.42 
 
 
462 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  26.91 
 
 
451 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  24.6 
 
 
451 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 
457 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.16 
 
 
462 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.28 
 
 
459 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0825  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.37 
 
 
446 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1091  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.04 
 
 
444 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  24.4 
 
 
453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  24.4 
 
 
453 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>