299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0827 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  82 
 
 
443 aa  728    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  81.78 
 
 
443 aa  733    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  79.5 
 
 
439 aa  698    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  880    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  61.9 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  42.18 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  41.92 
 
 
288 aa  250  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 
276 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  34.23 
 
 
274 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 
288 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
283 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 
287 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  28.83 
 
 
274 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  32.95 
 
 
288 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
287 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 
379 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.86 
 
 
379 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  29.54 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32 
 
 
375 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
375 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
279 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.19 
 
 
384 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 
373 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
242 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 
373 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
373 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.56 
 
 
379 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  27.9 
 
 
373 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 
383 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
373 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
373 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
373 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.82 
 
 
379 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.73 
 
 
373 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
373 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 
377 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 
373 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
374 aa  125  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
383 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
373 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
383 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 
379 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 
383 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
375 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 
373 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
372 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 
383 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.85 
 
 
384 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  29.33 
 
 
706 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.32 
 
 
308 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.92 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
381 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
384 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
371 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 
373 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 
373 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.28 
 
 
314 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.47 
 
 
313 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.63 
 
 
307 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.4 
 
 
311 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.6 
 
 
313 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.74 
 
 
313 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.6 
 
 
311 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.8 
 
 
375 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 
375 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 
281 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.81 
 
 
311 aa  96.7  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
283 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.16 
 
 
321 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.16 
 
 
321 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  23.98 
 
 
301 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.47 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  24.33 
 
 
375 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  24.46 
 
 
313 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.77 
 
 
294 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  27.1 
 
 
254 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.85 
 
 
312 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  24.12 
 
 
317 aa  89.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.92 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 
295 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  26.7 
 
 
237 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  24.41 
 
 
267 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.53 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.94 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>