More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1509 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
534 aa  1082    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  56.46 
 
 
525 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  55.7 
 
 
527 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  56.36 
 
 
525 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  53.08 
 
 
533 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  52.35 
 
 
531 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  53.79 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  54.46 
 
 
525 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  50.1 
 
 
511 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  48.96 
 
 
528 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  48.67 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  48.48 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  48.01 
 
 
528 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  47.82 
 
 
528 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  48.96 
 
 
527 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  48.01 
 
 
528 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  49.05 
 
 
525 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  49.81 
 
 
529 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  47.2 
 
 
533 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  48.3 
 
 
525 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  48.3 
 
 
542 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  45.01 
 
 
522 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  48.42 
 
 
536 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  42.29 
 
 
563 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  42.51 
 
 
563 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  40.19 
 
 
528 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
568 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  41.01 
 
 
570 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  41.2 
 
 
570 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  41.01 
 
 
570 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  42.13 
 
 
564 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  40.82 
 
 
545 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
565 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  40.44 
 
 
570 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  40.62 
 
 
570 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  40.62 
 
 
570 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
570 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 
570 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  40.6 
 
 
590 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  41.54 
 
 
573 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  40.26 
 
 
541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  40.26 
 
 
541 aa  360  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  42.4 
 
 
543 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 
593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  44.15 
 
 
542 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  41.2 
 
 
542 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  40.82 
 
 
542 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  43.58 
 
 
542 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  41.25 
 
 
579 aa  346  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  39.47 
 
 
545 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  41.1 
 
 
526 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  41.56 
 
 
538 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  39.09 
 
 
545 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  41.41 
 
 
534 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 
533 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  38.87 
 
 
512 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  38.33 
 
 
561 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.66 
 
 
553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 
533 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  39.14 
 
 
552 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  39.13 
 
 
529 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.59 
 
 
557 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 
568 aa  323  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  38.52 
 
 
545 aa  323  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 
543 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  37.67 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  40.07 
 
 
539 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  39.12 
 
 
531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  38.85 
 
 
537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  38.39 
 
 
552 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.89 
 
 
542 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  39.4 
 
 
539 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  37.31 
 
 
541 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
634 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  40.83 
 
 
562 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  36.26 
 
 
534 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  37.02 
 
 
537 aa  312  7.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
546 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  38.58 
 
 
540 aa  311  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.48 
 
 
546 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.58 
 
 
538 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 
531 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0872  gamma-glutamyltransferase  41.95 
 
 
530 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0889  gamma-glutamyltransferase  41.95 
 
 
530 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  38.83 
 
 
538 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  37.31 
 
 
535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  36.36 
 
 
534 aa  307  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  38.95 
 
 
536 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  38.69 
 
 
532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  39.73 
 
 
538 aa  302  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  37 
 
 
530 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  37.83 
 
 
549 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 
529 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>