More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0778 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  57.31 
 
 
451 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  52.63 
 
 
183 aa  171  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  60 
 
 
186 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.71 
 
 
506 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  51.46 
 
 
185 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  49.12 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.24 
 
 
508 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  52.05 
 
 
182 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  53.5 
 
 
183 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  52.05 
 
 
182 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  52.02 
 
 
191 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  50.65 
 
 
182 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  53.06 
 
 
185 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  52.03 
 
 
182 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  56.2 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  41.01 
 
 
210 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  54.23 
 
 
184 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  58.06 
 
 
184 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  42.61 
 
 
188 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.71 
 
 
196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  42.61 
 
 
211 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  42.13 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  43.68 
 
 
185 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  43.68 
 
 
185 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  42.94 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  44.63 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  44.25 
 
 
186 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  44 
 
 
186 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.81 
 
 
350 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2070  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.78 
 
 
247 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0975  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.52 
 
 
391 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0624997  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1349  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.51 
 
 
467 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000163511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  44.83 
 
 
186 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  41.95 
 
 
186 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.62 
 
 
457 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  41.81 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  42.22 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40 
 
 
512 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3177  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.95 
 
 
469 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  40.91 
 
 
211 aa  131  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  43.68 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2019  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase WbaP  40.21 
 
 
441 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.198196  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  43.82 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.25 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  36.79 
 
 
474 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2591  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.16 
 
 
230 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.84 
 
 
456 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2815  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.86 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.11 
 
 
477 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.42 
 
 
470 aa  128  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  45.95 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6387  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.5 
 
 
522 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  47.62 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1846  glycosyl transferase domain-containing protein  39.27 
 
 
277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325726  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  42.31 
 
 
219 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  51.35 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.43 
 
 
473 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1201  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.52 
 
 
429 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1932  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.18 
 
 
518 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  40.11 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4832  sugar transferase  39.49 
 
 
473 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0290406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3223  sugar transferase family protein  36.79 
 
 
382 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4266  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.47 
 
 
512 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164636  normal  0.415736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3275  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.79 
 
 
373 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1363  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.62 
 
 
239 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.585717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3261  sugar transferase family protein  36.79 
 
 
382 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  40.64 
 
 
310 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  39.25 
 
 
473 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2093  sugar transferase  39.04 
 
 
235 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0636821  hitchhiker  0.00000177418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3033  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  35.53 
 
 
478 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.25 
 
 
473 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.67 
 
 
358 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1433  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  38.76 
 
 
194 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5172  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.07 
 
 
502 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00967107  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.49 
 
 
471 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1064  sugar transferase  37.7 
 
 
378 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.07 
 
 
477 aa  121  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.05 
 
 
493 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.41 
 
 
506 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.89 
 
 
491 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  40.43 
 
 
228 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.78 
 
 
231 aa  121  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.32 
 
 
464 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.89 
 
 
472 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2371  sugar transferase  38.95 
 
 
488 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  36.17 
 
 
219 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5904  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.15 
 
 
358 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267413  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7401  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.62 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.59 
 
 
477 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.1 
 
 
456 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  36.51 
 
 
466 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0995  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.51 
 
 
477 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1171  glycosyl transferase CpsE  38.42 
 
 
462 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1370  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase, putative  42.19 
 
 
484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.419276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.5 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3137  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.86 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  38.59 
 
 
457 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.99 
 
 
501 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.67 
 
 
482 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>