More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0575 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
345 aa  713    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  45 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
312 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
310 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  43.16 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  43.64 
 
 
305 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  40.8 
 
 
333 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
311 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
301 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  41.02 
 
 
302 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
309 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
309 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
317 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
331 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  41.81 
 
 
316 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  40.53 
 
 
296 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
314 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  41.22 
 
 
317 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
306 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
301 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  39.11 
 
 
271 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  38.29 
 
 
307 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  40.93 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  39.05 
 
 
307 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 
308 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  41.3 
 
 
305 aa  205  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  41.83 
 
 
323 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  36.13 
 
 
302 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  37.76 
 
 
303 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  37.45 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  37.81 
 
 
277 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  34.52 
 
 
303 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  28.62 
 
 
318 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  29.12 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  29.58 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  30.8 
 
 
272 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  28.02 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  24.19 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  27.51 
 
 
279 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  26.04 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  24.84 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  28.17 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.48 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  29.23 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  28.09 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  22.43 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  28.72 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  26.89 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  31.61 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.17 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  30.71 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  26.16 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.02 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  26.27 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  30.6 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  25.79 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  27.72 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  27.15 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  23.65 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.09 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  27.43 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  26.07 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.09 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  24.74 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  25.91 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  25.08 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  24.74 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  23.55 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.74 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  26.22 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  24.17 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  25.55 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  29.21 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  28.79 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  28.24 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  26.33 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  25.19 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.74 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.26 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
284 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  25.96 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>