More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0512 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
265 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  61.9 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.69 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.16 
 
 
260 aa  297  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.06 
 
 
266 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.25 
 
 
266 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  47.17 
 
 
267 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.13 
 
 
243 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.64 
 
 
772 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 
240 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.57 
 
 
240 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.25 
 
 
776 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  48.78 
 
 
797 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  48.37 
 
 
787 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.53 
 
 
242 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.15 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.08 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  43.03 
 
 
663 aa  183  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.45 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  40.82 
 
 
241 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 
241 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 
241 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.75 
 
 
596 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.63 
 
 
241 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.43 
 
 
629 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  42.8 
 
 
423 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.87 
 
 
263 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
264 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 
327 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  46 
 
 
284 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  40.57 
 
 
238 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.71 
 
 
800 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 
631 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.61 
 
 
623 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.11 
 
 
253 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.61 
 
 
623 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  44.31 
 
 
331 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.35 
 
 
520 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.8 
 
 
778 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.73 
 
 
240 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.49 
 
 
245 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  39.69 
 
 
777 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.29 
 
 
250 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  45.68 
 
 
238 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.07 
 
 
320 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.02 
 
 
867 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  42.53 
 
 
329 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  42.53 
 
 
329 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  48.41 
 
 
561 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 
331 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.08 
 
 
837 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  42.35 
 
 
458 aa  168  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  41.31 
 
 
287 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.36 
 
 
250 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.18 
 
 
810 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.65 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.2 
 
 
245 aa  163  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.53 
 
 
329 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  43.2 
 
 
655 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  37.35 
 
 
468 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.06 
 
 
469 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  41.96 
 
 
326 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.38 
 
 
251 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.15 
 
 
345 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  42.13 
 
 
258 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.24 
 
 
328 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0144  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.23 
 
 
464 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.856588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.86 
 
 
249 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.3 
 
 
472 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.72 
 
 
236 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.55 
 
 
254 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  37.02 
 
 
567 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.13 
 
 
331 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.36 
 
 
435 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  44.76 
 
 
241 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.64 
 
 
567 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  40 
 
 
579 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.68 
 
 
258 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  37.05 
 
 
574 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 
257 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.69 
 
 
250 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.73 
 
 
222 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.2 
 
 
537 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.22 
 
 
565 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.29 
 
 
250 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.29 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.86 
 
 
560 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  35.71 
 
 
600 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.86 
 
 
560 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.57 
 
 
547 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
512 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3474  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  35.77 
 
 
284 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.1 
 
 
451 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38 
 
 
594 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  41.04 
 
 
559 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.31 
 
 
612 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  37.4 
 
 
564 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>